2003年4月，非典袭来。一场没有硝烟的战争吹响号角，捍卫人民生命健康的职责落在肩上。使命在肩，责无旁贷。我院迅速响应各级党委、政府的号召，成立了以王大文任组长、苗志敏任副组长的防非典领导小组，建立防非典指挥系统，成立了专门的防非典办公室，全面负责防非典工作。同时，在最短时间内组建了以秦筱梅教授为组长的防非典专家委员会，建立了疫情报告网络，实行每天零上报制度，不漏报一例病人。建立组建防非典青年突击队、防非典预备队和防非典预案，在物资、设施、人员各方面做好充分的备战准备。院党委、院行政及时召开全院防非典动员、誓师大会、举行全院职工签字表决心、突击队员宣誓等活动，向非典宣战。
医院在4天内建成布局严密、科学的临时发热门诊。并遵照堵、防、教、治原则，严把三关（预检关、呼吸门诊关、发热门诊关），无一例病人疏漏到普通门诊。这一措施被青岛市作为经验全面推广。健全十五项严密的规章制度，组织全院防非典培训班，对参加发热门诊工作的所有人员进行规范培训，并实施防非典工作模拟演练，提高医护人员防治非典工作的水平。在抗非工作的自始至终，医院党政领导带领工会等职能部门积极走访、慰问抗非医护人员家人，解决他们的实际困难，为一线医护人员解除后顾之忧，使他们得以安心工作，确保了抗非战斗的全面胜利。
在这场特殊的战斗中，涌现出大量感人的先进事迹。呼吸内科副主任于文成主动请战，前往青岛市胸科医院防治非典隔离病房一线参与、指导病人的救治工作。在最危险的时刻，他冲锋在前，不怕牺牲，荣立一等功。呼吸内科副主任程兆忠、ICU副主任医师李连弟两位同志临危受命，前往河北支援抗非典一线工作，为当地抗非工作做出了积极贡献，分别荣立个人三等功。呼吸内科教授秦筱梅、呼吸内科主任蒋捍东在青岛市和医院抗非典专家组工作中以身作则，不畏艰险，哪里有需要，哪里就有他们的身影。秦筱梅教授荣立个人一等功。
经过全院干部职工为期数月、不畏险难的团结奋战，医院防治非典工作取得了全面胜利。7月16日，我院被授予“山东省防治非典工作先进集体”荣誉称号，受到省委、省政府的表彰嘉奖。